W scenie kręconej w Amsterdamie tablice rejestracyjne samochodów nie są holenderskie (żółte z czarnymi literami), ale belgijskie (białe z czerwonymi literami).
W niektórych scenach rozgrywających się w Monachium w Berlinie, dźwięki policyjnych syren nie są niemieckie, lecz amerykańskie.
Niektóre ze scen w Moskwie zostały nakręcone w Berlinie. W tle widoczne są niemieckie znaki drogowe i reklamy.
Gdy Bourne ściga się w Moskwie z samochodem policyjnym zostaje przez niego uderzony od strony kierowcy. Szyba od tej strony zostaje stłuczona, a blacha pogięta. Jednak po kilku scenach szyba jest cała, a po jeszcze kilku blacha nieuszkodzona.
Na jednym z budynków w Moskwie widzimy logo firmy Tatra, która jest przedsiębiorstwem w Czechach i nie ma siedziby w Rosji.
Podczas podróży do Moskwy, pociąg (z Berlina), którym jedzie Bourne zatrzymuje się w Kijowie na Ukrainie, choć jedyną trasą kolejową łącząca Berlin i Moskwę jest stacja w Mińsku na Białorusi.
Kiedy Bourne dusi sznurem Jarda w tle można dostrzec sprzęt ekipy filmowej.
Kiedy Bourne walczy z napastnikiem w swoim mieszkaniu w Niemczech, można dostrzec odbicie kamerzysty w oknie.
Podczas pościgu policyjnego Bourne zostaje postrzelony w ramię. Jego ręce są wtedy zakrwawione, jednak w niektórych późniejszych ujęciach są zupełnie czyste.
W jednej ze scen w Moskwie napastnik zatrzymuje swoje auto i strzela w Bourne'a. Chwilę później, kiedy dojeżdża policja auto nagle znika.
W jednej scenie Bourne przetrzymuje Warda, który ma na sobie okulary. W kolejnych ujęciach okulary nagle znikają.
W pierwszej scenie możemy obserwować eksplozję. Jednakże pomiędzy ujęciami diametralnie zmienia się jej miejsce.
W jednej ze scen Bourne znajduje się w hotelowej łazience. Można wtedy na chwilę dostrzec odbicie górnej części głowy członka ekipy filmowej w lustrze.
Kiedy Kirill porywa SUV, drzwi samochodu są zamknięte. W kolejnym ujęciu drzwi są już otwarte.
Bourne przez cały film nosi pistolet SIG-Sauer P225. Jednakże, kiedy grozi Abottowi trzyma w ręce pistolet Walther P99.
Podczas sceny gdy Abbott dźga nożem młodego agenta, w momencie zadawanego ciosu nie ma rękawiczki, a sekundę później ma obydwie na rękach.
Zdjęcia do filmu zrealizowano w Berlinie i Poczdamie (Niemcy), Amsterdamie (Holandia), Neapolu (Włochy), Goa, Panaji i Nerul (Indie) oraz w Moskwie (Rosja) i Nowym Jorku (Nowy Jork, USA).
Aby nadać filmowi charakterystyczny pseudo-dokumentalny styl Paul Greengrass zdecydował o filmowaniu przede wszystkim "z ręki" i unikał jak ognia komputerowych efektów specjalnych - np. wszystkie sceny kaskaderskie są "naturalne", a nie wspomagane komputerowo.
Matt Damon przypadkowo znokautował Tima Griffina, który grał negocjatora CIA Johna Nevinsa w trakcie sceny w konsulacie, podczas której Bourne walczy z nim i ochroniarzem po zatrzymaniu.
Data urodzin Nicky, znajdująca się w aktach Treadstone to 28 marca 1981. Wtedy też urodziła się grająca tę postać aktorka, Julia Stiles.
Zanim Brian Helgeland napisał swoją wersję scenariusza, wersja Tony'ego Gilroya była zupełnie inna. W jego wersji Marie ginie pod kołami autobusu w Indiach. Bourne'a ogarnia szał i prawie zabija kierowcę, przez co zostaje aresztowany przez policję. Następnie spędza długi czas w więzieniu planując ucieczkę. Od sceny ucieczki, oba scenariusze idą tym samym torem.
W scenie, gdy Bourne chce dotrzeć do miejsca gdzie popełnił zabójstwo na Neskim, jedzie do hotelu Brecker na ulicę Kurtürstendamm 288. Tak naprawdę ulica ta nazywa się Kurfürstendamm i jest jedną z najbardziej znanych w Berlinie.
Zdjęcia do filmu kręcono od 10 listopada 2003 roku do lutego 2004 roku.